第一章绪论
1.1研究背景
1.1.1生物信息数据库是生物信息学研究的主要任务之一
生物信息学（Bioinformatics)是伴随着人类基因组计划（HGP)的幵展而迅速发展起来的一门学科，是由生物科学、计算机科学、信息科学、应用数学、统计学等多门学科相互交叉而形成的一门新兴学科。它以计算机为主要工具，开发各种软件，对円益增长的DNA和蛋白质的序列和结构等相关信息进行收集、储存、发行、提取、加工、分析和研究，同时建立理论模型，指导试验研究，它由数据库、计算机网络和应用软件三大部分构成【2】。它包含了两个方面：一是对海量数据的收集、整理与服务；另一方面是从中发现新的规律，也就是用好这些数据。是利用计算机对生命科学研究中的生物信息进行存储、检索和分析的科学。生物信息数据库是典型的生物技术与信息技术相结合的产物，对生命科学的发展起着重要的推动作用。陈润生认为“生物信息学的重要研究任务之一是生物信息数据库的建设”，并指出：“在数据库研究中有两点特别重要，一是构建我国自己的数据库；二是与国际常用数据库的有效连接和及时更新【3】。”目前，欧盟、美国、円本等国家为生物信息数据库的开发和建设均投入了大量的人力、物力和财力，建成了一批具有极高应用价值的生物信息数据库，为本国及世界生命科学的发展作出了巨大的贡献。
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1.2研究目标与内容
1.2.1研究目标
在现代信息环境下，数据库、知识库、人工智能库等先进的信息技术，具有知识推理能力、知识检索能力的自助式知识服务技术平台对于科学研究知识创新有着极其重要的支撑作用。本项研究的目标是依据现代信息学理论，运用现代信息技术，研究设计开发一个知识创新网络服务平台架构体系，并以四川农业大学生物信息科学为例通过四川农业大学知识创新服务网络平台的系统功能展示体现设计理念和技术方法。具体目标分为三个层面：
(1)可实现学科知识资产的集中管理与保存。
(2)可实现学科知识资产的集中展示、传播与共享。
(3)创建四川农业大学生物信息学科体系知识库增殖服务体系——拓展知识库的服务空间。
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第二章文献综述
2.1生物信息学研究进展
2.1.1生物信息学的产生和发展
生物信息学（Bioinformatics)萌生于计算机初创期，主要源于计算机在分子生物科学中的应用。事实上，生物信息学的发展与分子生物科学及计算机网络技术是密不可分，生物医药的迅速发展及其经济的需求也助推了其发展。自二十世纪70年代基因重组技术问世，现代分子生物科学便开始蓬勃发展。分子生物学的长足进展，把生命活动的物质基础追溯到核酸和蛋白质两大类生物大分子的序列。特别是伴随着人类基因组计划（Human Genome Project，简称HGP)的开展，生命科学进入了更为广泛的研究领域，并产生了大量的DNA信息。同一时期，Internet网亦平行发展起来，自1969年在美国国防部国防髙级研究计划署的资助下建立了名为ARPAnet的网络，Internet网最早的雏形就出现了。
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2.2机构知识库的研究进展
机构知识库(Institutional Repository，简称IR)，也称机构库、机构仓储、机构典藏。迄今仍没有一个统一的定义。在众多定义中，以学术出版和学术资源联盟组织的高级顾问Raym Crow及美国网络信息联盟的常务董事Clifford A. Lynch所提出的观点最具代表性。Raym Crow认为：机构知识库是学术机构为捕获并保存本机构的智力成果而建立的数字资源仓库，他主要是从资源的角度阐述了知识机构库的含义。而Clifford A. Lynch则从服务的角度给予解释，认为：机构知识库是数字时代学术研究的基础设施，一个大学的机构知识库是学校为师生员工所提供的一系列服务，用于管理和发布由本机构及其成员所产生的数字化资料。
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第三章四川农业大学生物信息科学知识创新服务平台系统的设计与开发.............31
3. 1系统设计.............31
3.2系统软件与主要性能.............33
3.3技术路线.............35
3. 4系统核心技术.............36
3. 5系统框架及功能模块.............40
3.6资源数据库建设.............53
第四章研究结果与讨论.............56
4. 1完成了 “四川农业大学知识创新服务平台”方案的设计.............56
4.2数据资源建设.............56
4.3知识创新服务平台网页.............58
4. 4学术统计分析工具.............59
4.5开辟硕博士空间.............59
4.6科研查新服务.............59
4.7建立生物信息学网站导航.............60
4.8学术信息发布.............60
第五章四川农业大学知识创新服务平台演示
5.1知识创新服务平台概述
四川农业大学知识创新服务平台是一个基于全校生物信息学科体系的、完整的、统一的、权威的学术资源网络平台，最大限度地采集、整合并保存全校师生、研究团队该领域的各类型学术成果资源，实现对这些成果的永久保存和广泛传播，促进知识共享与知识再创造，为校内外用户创建一个多层次的、功能丰富的生物信息科学创新服务平台。该平台将机构知识库、学科知识库和特色数据库进行有机结合，作为学校机构知识库的重要组成部分。知识创新服务平台的主页如图5-1。
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第六章结论、创新点与展望
6.1结论
6.1.1完成了预期目标，平台已开始运行
本项研究依据现代信息学理论，运用现代信息技术，研究设计开发了一个知识创新网络服务平台架构体系，并以四川农业大学生物信息科学为例，完成了 “四川农业大学知识创新服务平台”的建设，并已投入运行。
6.1.2各项检索和服务功能均已实现
(1)知识创新服务平台中的各种检索功能、服务功能均已实现。方便读者了解学校现有成果及本学科领域最新动态，为读者利用文献及各类成果提供了方便。
(2)平台中嵌入的学术统计分析工具，为学校及学院了解本单位的科研产出、科技成果及学院间纵向、横向比较提供了方便；为学校领导决策提供依据。
(3)学位论文提交及硕博士空间的幵通，为研究生之间及研究生与导师之间的交流提供了可能和方便。
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参考文献（略）