摘要 4-6
Abstract 6-7
引言 12-13
1 文献综述 13-25
1.1 同源模建 13-14
1.1.1 同源模建简介 13
1.1.2 同源模建的基本步骤 13-14
1.2 分子对接 14-16
1.2.1 分子对接简介 14-15
1.2.2 分子对接的基本步骤 15-16
1.3 降纤酶及免疫原性 16-19
1.3.1 降纤酶的临床应用及主要问题 16
1.3.2 免疫原性 16-19
1.4 果胶甲基酯酶 19-21
1.4.1 果胶甲基酯酶概述 19-20
1.4.2 黄曲霉果胶甲基酯酶抑制剂的研究意义 20-21
1.5 趋化因子 21-23
1.5.1 趋化因子简介 21-22
1.5.2 趋化因子表达与纯化的研究进展 22-23
1.5.3 趋化因子及其受体抑制剂的研究进展 23
1.6 选题依据和研究内容 23-25
1.6.1 选题依据 23-24
1.6.2 研究内容 24-25
2 白眉蝮蛇降纤酶的同源模建及B细胞抗原表位预测 25-36
2.1 引言 25-26
2.2 材料与方法 26-27
2.2.1 降纤酶氨基酸序列选择 26
2.2.2 白眉蝮蛇降纤酶的线性抗原表位预测 26-27
2.2.3 序列比对和基因树 27
2.2.4 白眉蝮蛇降纤酶的同源模建 27
2.2.5 白眉蝮蛇降纤酶的构象型抗原表位预测 27
2.3 结果与分析 27-35
2.3.1 白眉蝮蛇降纤酶的氨基酸序列 27-28
2.3.2 白眉蝮蛇降纤酶的二级结构及B细胞线性抗原表位的预测结果 28-31
2.3.3 白眉蝮蛇降纤酶的同源模建结果 31-33
2.3.4 白眉蝮蛇降纤酶的B细胞构象型抗原表位 33-35
2.4 小结 35-36
3 黄曲霉果胶甲基酯酶的同源模建及其抑制机理分析 36-47
3.1 引言 36-37
3.2 材料与方法 37-39
3.2.1 黄曲霉果胶甲基酯酶的序列确定 37
3.2.2 多重序列比对 37
3.2.3 模型的能量最小化优化与评价 37
3.2.4 分子对接 37-39
3.3 结果与分析 39-46
3.3.1 Blastp序列比对结果 39-40
3.3.2 PROMAL 3D序列比对结果 40-42
3.3.3 同源模建 42
3.3.4 同源模建的评价 42-44
3.3.5 抑制剂的分子对接结果 44-46
3.4 小结 46-47
4 人来源趋化因子CCL 1的重组制备、同源模建及抑制机理分析 47-57
4.1 引言 47
4.2 材料与方法 47-50
4.2.1 实验材料 47-48
4.2.2 pET-28a(+)-CCL1表达载体转化大肠杆菌BL21(DE3) 48-49
4.2.3 重组人来源趋化因子CCL1的表达 49
4.2.4 重组人来源趋化因子CCL1的分离纯化 49
4.2.5 Western blotting 49-50
4.2.6 重组人来源趋化因子CCL1的复性 50
4.2.7 酶活力检测和抑制剂的筛选 50
4.2.8 同源模建与分子对接 50
4.3 结果与分析 50-56
4.3.1 阳性克隆的筛选 50-51
4.3.2 CCL1在大肠杆菌细胞中的表达 51-52
4.3.3 人来源的趋化因子CCL1的分离纯化 52
4.3.4 人来源趋化因子CCL1的同源模建 52-53
4.3.5 人来源趋化因子CCL1抑制剂的筛选及抑制机理分析 53-56
4.4 小结 56-57
结论 57-58
参考文献 58-65
附录A 常用仪器一览表 65-66
附录B 大肠杆菌转化 66-67
附录C Western Blotting 67-68
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 68-69
致谢 69-70